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一個通用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)——R的簡介

  簡介

  R (http://www.r-project.org) 系統(tǒng)是用于統(tǒng)計分析和圖形化的計算機語言及分析工具,為了保證性能,其核心計算模塊是用C、C++和Fortran編寫的。同時為了便于使用,它提供了一種腳本語言,即R語言。R語言和貝爾實驗室開發(fā)的S語言類似。R支持一系列分析技術(shù),包括統(tǒng)計檢驗、預(yù)測建模、數(shù)據(jù)可視化等等。在CRAN(http://cran.r-project.org) 上可以找到眾多開源的擴展包。

  一個通用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)——R的簡介

  R軟件的首選界面是命令行界面,通過編寫腳本來調(diào)用分析功能。如果缺乏編程技能,也可使用圖形界面,比如使用RCommander(http://socserv.mcmaster.ca/jfox/Misc/Rcmdr/)或Rattle(http://rattle.togaware.com)。[2]

  另外,由于R系統(tǒng)是本文研究的重點,所以會花費較大篇幅對其各種特性、優(yōu)勢及不足進行較為細致的分析。

  主要功能

  如前所述,R系統(tǒng)是一種腳本語言,它主要以命令方式提供了對各種數(shù)據(jù)的處理和統(tǒng)計分析過程,主要能力或功能描述如下:

  1.數(shù)據(jù)導(dǎo)入和導(dǎo)出:可以從文件中獲取數(shù)據(jù),將處理結(jié)果存放到數(shù)據(jù)文件中;如HousePrice <- read.table("houses.data");data(Puromycin, package="datasets");attach(“faithful”)

  2.向量數(shù)據(jù)處理能力:它可以處理向量數(shù)據(jù)(包括數(shù)值、邏輯和字符串),也可以按一定規(guī)則生成向量數(shù)據(jù);支持向量運算(+、-、*、/、冪運算);

  向量賦值:x <- c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7);y <- c(x, 0, x)

  向量運算:1/x;v <- 2*x + y + 1;sum((x-mean(x))^2)/(length(x)-1)

  向量生成:z <- 0:9;s4 <- seq(length=51,from=-5, by=.2)

  3.復(fù)雜數(shù)據(jù)處理能力:支持矩陣、支持列表數(shù)據(jù)類型(元素不同)、數(shù)據(jù)幀(類似矩陣,但元素類型可不同);

  因子(集合):

  state <- c("tas", "sa", "qld","nsw", "nsw", "nt", "wa","wa","qld", "vic", "nsw","vic", "qld", "qld", "sa","tas","sa", "nt", "wa","vic", "qld", "nsw", "nsw","wa","sa", "act", "nsw","vic", "vic", "act");statef<- factor(state)

  n數(shù)組或矩陣:dim(z) <- c(3,5,100);x <- array(1:20, dim=c(4,5))

  n列表:Lst <- list(name="Fred", wife="Mary",no.children=3,child.ages=c(4,7,9))

  n數(shù)據(jù)幀:accountants <- data.frame(home=statef, loot=incomes, shot=incomef)

  4.支持函數(shù):包括系統(tǒng)內(nèi)置函數(shù)和用戶定義函數(shù);自定義函數(shù)舉例如下:

  twosam <- function(y1, y2) {

  n1 <- length(y1); n2 <- length(y2)

  yb1 <- mean(y1); yb2 <- mean(y2)

  s1 <- var(y1); s2 <- var(y2)

  s <- ((n1-1)*s1 + (n2-1)*s2)/(n1+n2-2)

  tst <- (yb1 – yb2)/sqrt(s*(1/n1 + 1/n2))

  tst

  }

  5.概率分布:支持多種概率分布模型,如下:

  nBeta:貝塔分布

  nBinomial:二項分布

  nCauchy:柯西分布

  nchi-squared:卡方分布

  nexponential:指數(shù)分布

  nF:F分布

  nGamma:伽馬分布

  nGeometric:幾何分布

  nHypergeometric:超集合分布

  nlog-normal:對數(shù)正態(tài)分布

  nlogistic:對數(shù)分布

  nnegativebinomial:負二項分布

  nnormal:正態(tài)分布

  nPoisson:泊松分布

  nsignedrank:符號秩次分布

  nStudent:學(xué)生氏分布

  nUniform:單一分布

  nWeibull:Weibull分布

  nWilcoxon:威爾考克斯分布

  以下為分布的舉例:

  n正態(tài)分布:

  attach(faithful)

  long <-eruptions[eruptions > 3]

  plot(ecdf(long),do.points=FALSE, verticals=TRUE)

  x <- seq(3, 5.4,0.01)

  lines(x, pnorm(x, mean=mean(long),sd=sqrt(var(long))), lty=3)

  上述命令生成的圖如下:

  6.支持條件語句和循環(huán)語句

  條件語句:if (expr_1) expr_2 else expr_3

  循環(huán)語句:

  xc <- split(x, ind)

  yc <- split(y, ind)

  for (i in 1:length(yc)) {

  plot(xc[[i]], yc[[i]])

  abline(lsfit(xc[[i]], yc[[i]]))

  }

  7.支持多種圖型化的數(shù)據(jù)表達方式,舉例如下(直方圖):

  x <- c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7)

  hist(x)

  spacer.gif

  優(yōu)勢

  R系統(tǒng)具有如下優(yōu)勢:

  1.因其為單行命令模式,所以對于一般有開發(fā)經(jīng)驗的用戶,簡便易學(xué),容易上手;

  2.數(shù)據(jù)類型支持豐富;

  3.支持的概率分布模型較全面,一般能滿足日常使用;而且支持通用的假設(shè)檢驗方法;

  4.支持流程控制和自定義函數(shù)。

  不足

  但R系統(tǒng)也有如下缺點:

  1.雖然簡便易學(xué),和純粹基于圖型的挖掘工具相較,使用起來仍不夠直觀、方便;

  2.對使用人員而言,仍有一定的要求;

  3.一般只能從文件中獲取數(shù)據(jù),無法和數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)相結(jié)合。

  n指數(shù)分布:

  x <- seq(1, 5, 0.01)

  plot(pexp(x,3))

  生成的統(tǒng)計圖如下:

  6.支持條件語句和循環(huán)語句

  條件語句:if (expr_1) expr_2 else expr_3

  循環(huán)語句:

  xc <- split(x, ind)

  yc <- split(y, ind)

  for (i in 1:length(yc)) {

  plot(xc[[i]], yc[[i]])

  abline(lsfit(xc[[i]], yc[[i]]))

  }

  7.支持多種圖型化的數(shù)據(jù)表達方式,舉例如下(直方圖):

  x <- c(10.4, 5.6, 3.1, 6.4, 21.7)

  hist(x)

  優(yōu)勢

  R系統(tǒng)具有如下優(yōu)勢:

  1.因其為單行命令模式,所以對于一般有開發(fā)經(jīng)驗的用戶,簡便易學(xué),容易上手;

  2.數(shù)據(jù)類型支持豐富;

  3.支持的概率分布模型較全面,一般能滿足日常使用;而且支持通用的假設(shè)檢驗方法;

  4.支持流程控制和自定義函數(shù)。

  不足

  但R系統(tǒng)也有如下缺點:

  1.雖然簡便易學(xué),和純粹基于圖型的挖掘工具相較,使用起來仍不夠直觀、方便;

  2.對使用人員而言,仍有一定的要求;

  3.一般只能從文件中獲取數(shù)據(jù),無法和數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)相結(jié)合。

 

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